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一、頭部：腦出血，腦梗塞，動脈瘤，血管畸形，各種腫瘤，外傷，出血，骨折，先天畸形等;

二、 胸部：肺、胸膜及縱隔各種腫瘤，肺結核，肺炎，支氣管擴張，肺膿腫，囊腫，肺不張，氣胸，骨折等;

三、 腹、盆腔：各種實質器官的腫瘤、外傷、出血，肝硬化，膽結石，泌尿系結石、積水，膀胱、前列腺病變，某些炎癥、畸形等;

四、 脊柱、四肢：骨折，外傷，骨質增生，椎間盤病變，椎管狹窄，腫瘤，結核等;

五、 骨骼、血管三維重建成像;各部位的MPR、MIP成像等;

六、 CTA(CT血管成像)：大動脈炎，動脈硬化閉塞癥，主動脈瘤及夾層等;

七、 甲狀腺疾病：甲狀腺腺瘤、甲狀腺腺癌等;

其他：眼科及眼眶腫瘤，外傷;副鼻竇炎、鼻息肉、腫瘤、囊腫、外傷等。

由于CT的高分辨力，可使器官和結構清楚顯影，能清楚顯示出病變。在臨床上，神經系統與頭頸部CT診斷應用早，對腦瘤、腦外傷、腦血管意外、腦的炎癥與寄生蟲病、腦先天畸形和腦實質性病變等診斷價值大。在五官科診斷中，對于框內腫瘤、鼻竇、咽喉部腫瘤，特別是內耳發育異常有診斷價值。

在呼吸系統診斷中，對肺癌的診斷、縱隔腫瘤的檢查和瘤體內部結構以及肺門及縱隔有無淋巴結的轉移，做CT檢查做出的診斷都是比較可靠的。

在心臟大血管和骨骼肌肉系統的檢查中也是有診斷價值的。